在唐帝国排兵布阵，准备再次拉开战役序幕的时候，美国方面也在做大的调整。早在六月初，美国情报部门就判断唐帝国的下一个进攻目标多半会是西南太平洋上的岛屿，然后寻找登6澳洲大6的机会。
为了应对新的挑战，美国也在对自己的战争指挥机构做出调整。如果仍然由太平洋战区司令部负责太平洋方向上的作战行动的话，显然无法照顾到每个方面。另外，西南太平洋方向上的情况与太平洋其他的区有很大的差别。在这个方向上，澳洲大6的防御是重中之重，另外密集的岛屿分布也决定了地面战场的重要性。因此，在马里亚纳群岛战役还没有结束的时候，美国海6两军就达成了协议，在太平洋战区之外，再成立一个新的战区，及西南太平洋战区。
这个编制变化实际上与唐帝国的改革是完全一样的，美国也将西南太平洋地区划了出来，成立新的战区。为了平衡海6两军，西南太平洋战区司令官不是由海军将领出任，而是由一名6军将领，也就是美国驻澳军团总司令麦克阿瑟上将出任。
麦克阿瑟一直就是美军驻澳军团的总司令，在美国参战的时候，他与尼米兹各提出了一套进攻方案。他提出的方案是从澳洲出，进军南洋地区，从南部威胁到唐帝国的本土。这个计划后来被否决了，因为当时美军在澳洲兵力连防御都嫌少，哪有力量去扫荡南洋地区而且，这样的作战计划必然要调动大批海军舰队，而美军在澳洲的港口设施是不足以支持整个太平洋舰队的。更重要的是，唐军已经巩固了南洋地区的防御，而美军主要部署在澳洲的东南部地区，在澳洲北部地区的军事基地少得可怜，能够部署轰炸机的机场更是少得可怜，要想动进攻南洋地战役行动。就至少需要数千架轰炸机的支持，不说这些轰炸机的调动是个严峻的考验，就算调到了澳洲大6去，恐怕也难以派上战场。
因为自己的提议遭到否决，麦克阿瑟曾一度向上反应，甚至闹到了总统那里，希望能够改变作战计划，将重点放到西南太平洋上来来。让6军打上主力。结果还是不了了之。在马里亚纳群岛战役失败之后，麦克阿瑟更是四处活动，一方面指责尼米兹的指挥失误，一方面推广自己的作战计划，力吹进攻南洋的重要性。在麦克阿瑟地游说下，美国6军总参谋长美国6军没有总司令，只有总参谋长马歇尔上将，以及美国海军总司令金上将最后做出了让步，决定加强西南太平洋的部署，逐步将重点转移到西南太平洋战场上。如果唐军不在西南太平洋上进攻的话。那么就要尽量争取向南洋地区挺进。当然，这只是个计划而已，在没有足够的制海权保障的情况下。美队要想跨过大海，进攻南洋地区，这几乎是不可能的事情。
实际上，尼米兹在马里亚纳群岛战役中的指挥并没有什么大的错误，而且其委任的几位舰队司令官都在作战行动中完成了任务，哈尔西，斯普鲁恩斯都重创了唐帝国海军，挽回了局面。美军失败的原因是实力不如对手。从这场战役双方地投入，损失等各方面来看，美军明显处于下风。能够在数十万唐军的重压之下顶住半年，这已经是个了不起的奇迹了。因此，尼米兹并没有受到指责，没有理由要他来承担失败的责任。但是有一点是无法回避地，麦克阿瑟的指责必须要有人来做出答复，结果就是将太平洋战区一分为二，尼米兹负责处西南太平洋战区之外的其他的区的作战行动，而西南太平洋战区则由麦克阿瑟担任最高指挥官。
随着战区制度的改变，美国海军太平洋舰队的编制也出现了变化。在没有足够战舰的情况下。美国海军采用了一套全新的编制体系，即舰队的指挥体系基本不变，但战舰在不同战区执行作战任务，就分配到不同的舰队去。
变革之后地美国太平洋舰队分成了两支主力舰队，其中在尼米兹指挥下的为第五舰队，由原太平洋舰队司令部改组为第五舰队司令部。在麦克阿瑟指挥下的为第三舰队，由部分原太平洋舰队的参谋军官，以及一些从大西洋舰队调来的参谋军官组建舰队司令部。也就是说，第五舰队负责太平洋战区内的作战行动，而第三舰队则负责西南太平洋战区内的作战行动。而这套体制后来还扩大到了整个美国海军，编号为单数的为太平洋方向上的舰队，而编号为双数地则为大西洋方向上的舰队。
实际上，美国海军舰队的编制体系与唐帝国海军的舰队编制有异曲同工之妙。唐帝国海军没有严格规定舰队的番号，但特混舰队在不同的战区接受不同的战区司令部的指挥。这样，舰队的完整性基本上得到了保证，因此指挥舰队作战的都是一套班子，不存在临时换人，以及指挥官来熟悉舰队的情况，这能够提高舰队在残酷战斗中的战斗力。相反，美国海军则重点保证了战舰官兵编制的完整性，舰队指挥班子则将在不同的战区内更换，这实际上是保证了战舰的作战连续性，一艘战舰可以在几个战区内奔波，持续作战。实际上，这都是由两国不同的情况所决定的，唐帝国拥有战舰上的优势，更重视在重要海战中的表现，而美国海军却暂时缺乏足够的战舰，所以更重视战舰的出勤率。
在舰队的编制改变之后，美国海军太平洋舰队的人事关系也生了变化。哈尔西已经伤愈复出，结果他被分配到了西南太平洋战区，负责指挥第三舰队，而斯普鲁恩斯则留在了太平洋战区，尼米兹还提拔他为战区参谋长，做他的副手，这不能不说是尼米兹对斯普鲁恩斯的重视。另外，还有一大批的将领被提拔了起来，被安排到了重要的位置上，比如特纳等人，都被征用。弗莱彻也已经伤愈复出，他没有立即返回舰队，而是留在了太平洋战区，等待新的安排。
到六月底，也就是美国太平洋地区的变革基本上完成之后，美军的情报部门也获得了消息，唐帝国即将在太平洋上展开新的进攻，而进攻方向很有可能是西南太平洋上地卑斯麦群岛。或者是中太平洋上的夏威夷群岛。很快，唐军的调动情况也被送了过来，对比这些消息之后，尼米兹立即判断，唐军的下一步进攻将以西南太平洋为主，但肯定会在中太平洋上展开进攻，以牵制住美国海军。
尼米兹的判断是很准确的，而且他立即就将这一判断汇报给了金上将，消息也很快送到了麦克阿瑟的手中。麦克阿瑟的判断也差不多，唐帝国暂时无力进攻夏威夷群岛。而且进攻夏威夷群岛地战线过于漫长。唐帝国在拥有了绝对的海上优势之前，是不会东进的。那么，在美国海军暂时无力挑战唐帝国海军的制海权的时候。唐帝国海军要想扩大战果，掌握太平洋上的主动权，肯定会起新的进攻，如果能够扫荡西南太平洋，将美军赶出澳洲的话，那么美国就只能退守夏威夷群岛到萨摩亚群岛这条防线，失去了在西太平洋上活动与反击的能力，战线将被拉平，为唐帝国最终进军美洲大6铺平道路。
美军的调动也很快就开始了，到七月中旬之前。美国已经派出了五支船队，将至少15个师地地面部队，上千架作战飞机，以及大量地战争物资送往了澳洲这批物资最快只能在七月底到达，而最慢要在八月中旬到达可问题是，当时美国海军在太平洋上的力量少得可怜，仅仅只有企业号一支航母战斗群，而且，这艘航母的维修工作只要要持续到七月中旬。也就是说，美国海军实际上是没有能力阻止唐帝国南下西南太平洋地。
情况已经危险到不能再危险了。尼米兹已经勒令珍珠港的修船厂必须在七月十五日之前修好企业号航母，航母战斗群将在七月二十日之前恢复战斗力。接着，他安排了新的舰队指挥官。最好的选择肯定是斯普鲁恩斯，现在哈尔西已经去了西南太平洋战区，而斯普鲁恩斯已经在上一次海战中证明了他的能力上次海战的失败，责任在第1第16特混舰队没有能够挡住唐帝国轰炸机的打击，毕竟第17特混舰队取得的战果远比损失大可现在斯普鲁恩斯是战区参谋长，有更重要的责任。最后，尼米兹不得不启用弗莱彻，让弗莱彻指挥企业号航母战斗群，作好与唐帝国海军特混舰队交战的准备。
西南太平洋战区，麦克阿瑟也在做着积极地战前准备工作。唐帝国如果想南下澳洲的话，那么就先得获取前进基地，卑斯麦群岛，所罗门群岛还有新几内亚岛都是理想的前进基地。也就是说，唐军有可能在这里的数十个岛屿中任选一个，开辟新的战场。作为被动防御的一方，麦克阿瑟的选择余地很少。要想在漫长的防线上保证每一座岛屿都有足够的防御兵力，这几乎是不可能办到地事情，这也是所有防御指挥官所要面对的麻烦。进攻的一方可以选择任何一处突破点，而防御的一方则不可能在任何一处地点都部署足够的兵力。结果，麦克阿瑟做了一个比较保守的防御部署，即先保证莫尔兹比港与所罗门群岛的安全，然后利用这些地方部署的飞机来掩护卑斯麦群岛以及莱城。这一部署也比较符合当时美军在西南太平洋上的情况，麦克阿瑟没有足够的本钱在一线与唐军进行正面对抗，他只能把希望寄托在纵深防线上，希望借助防御纵深来拖垮唐军。
到七月中旬的时候，美军获得确切情报，唐帝国的主要进攻方向就是卑斯麦群岛与新几内亚岛，而且会提前在中太平洋上动一次牵制性进攻，让美国海军仅有的舰队无法南下。尼米兹也很快做出了反应，在得知唐帝国的三支特混舰队已经离开了母港，而新成立的特混舰队也进入了南海海域之后，他立即命令刚恢复战斗力的企业号航母战斗群出，前往中途岛待命，等待与唐帝国海军舰队的决战。
西南太平洋上，麦克阿瑟的调动也立即展开，到七月底之前，他向所罗门群岛与莫尔兹比港部署了至少5第三舰队其中一部分是澳洲地方军队的战舰也离开了布里斯班港，开赴珊瑚海，准备随时支援遭到攻击的前线部队。
到这个时候，双方都已经拉开了架势，准备迎接新的战斗，但战争的主动权仍然在唐帝国的手里，美军只是通过有限的情报，以及猜测来判断唐帝国的进攻方向，而无法获知唐帝队的确切调动情况。比如，当时尼米兹就不知道，正在向东航行的到底是一支特混舰队还是两支特混舰队，因此他将企业号航母战斗群，也就是第第五舰队，而第一支特混舰队留在了中途岛，而没有派到威克岛附近海域去。
麦克阿瑟这边也极为被动，他能够感觉到唐军的进攻地点肯定是在新几内亚岛的东北部方向，很有可能是莱城，或者是卑斯麦群岛中的某座有大型机场，而且可以驻扎大量部队的岛屿，而且很有可能是新不列颠岛。但有了判断不等于就能做出相应的部署，因为他的手里没有足够的资本